Rozpoczynając leczenie ropnia, pierwszym etapem jest stosowanie antybiotyków, mających na celu złagodzenie objawów stanu zapalnego. Kolejnym krokiem jest całkowite usunięcie ropnia, a czas trwania zabiegu waha się od 10 minut do 1 godziny. W zależności od rozmiaru ropnia i zaleceń chirurga ogólnego, który przeprowadza zabieg, może być stosowane znieczulenie miejscowe lub ogólne. Po zabiegu z użyciem znieczulenia miejscowego pacjent może wrócić do domu tego samego dnia, natomiast przy zastosowaniu znieczulenia ogólnego konieczny jest krótszy pobyt w klinice w Krakowie.
W trakcie procedury chirurg ogólny przecina skórę wokół ropnia, a następnie dokonuje drenażu, mającego na celu dokładne oczyszczenie tkanek z bakterii. W niektórych przypadkach może być konieczne pozostawienie drenu lub sączka, ułatwiającego odpływ ropie z organizmu. Na zakończenie zabiegu chirurg ogólny zakłada szwy i ochronny opatrunek. Pobrany płyn z ropnia jest wysyłany do badania laboratoryjnego (histopatologicznego), co pozwala określić, jaka bakteria spowodowała stan zapalny.